А если бороться не с причиной, а последствиями? Предлагаю:
Перед фильтром поставить банку с 3мя патрубками
фильтр.jpg
1- входной из бака
2- выходной без воздуха, направляем в фильтр
3- для откачки воздуха
4- датчик уровня 1 (шарик или иной датчик)
5- датчик уровня 2
на выход 3 вешаем насос мембранного типа, чтобы он мог качать воздух и создавать хорошее разряжение воздуха. При этом обратно воздух не проходит. (напримет топливный насос от вебасто). Как только датчик 1 определяет низкий уровень топлива, насос включается и откачивает воздух. Так только топливо налилось до уровня датчика 2, насос отключается.