Совершенно верно, этот файл Вы так просто не увидите, т.к. при запуске системы видите Вы не Windows CE, а оболочку, которую Вам предоставил производитель.
Запуск данного файла возможен, например, из Total Commander (его надо установить дополнительно, см. профильные темы), либо, как делает большинство, путем автоматической загрузки при использовании альтернативных меню для штатной магнитолы. Ссылки и некоторые ремарки были и в этой теме, также необходимо изучить
http://www.syclub.ru/showthread.php?t=7972 и прочие смежные темы.