Я, тоже думаю, что пыль с тканевых ковриков. Надо смотреть после замены на резиновые. Будет или нет пылится. А так, даже после пропылесосенных, нанесётся грязь с подошв обуви. Если уж при движении по пыльным дорогах будет появляться явное запыление салона, то смотреть уплотнители дверные. Я, думаю, должно быть заметно, откуда идет подсос пыли.
Как вариант, протирать обувь губкой, при выходе из машины, раз уж так строго относитесь к чистоте лакированной обуви.
ЗЫ. На кроссовках не видно пыли.